Aleksandr abiellus kolm korda: Roxana, Sogdi aadli Oxyartesi tütar Baktriast, armastusest; ja Pärsia printsessid Stateira II ja Parysatis II, endine Darius III tütar ja Artaxerxes III tütar, poliitilistel põhjustel. Tema ilmselgelt oli Roxana ja tõenäoliselt Makedoonia herakles oma poisil Barsine'l kaks poega, Makedoonia Aleksander IV. Ta kaotas teise lapse, kui Roxana sai Babüloonis end ära.Alexanderil oli ka tihe seos tema sõbra, üldise ja ihukaitsjaga Hephaestion, Makedoonia üllas poeg. Hephaestioni surm hävitas Aleksander. See sündmus võib olla kaasa aidanud Aleksander puudulikule tervisele ja lahutatud vaimsele seisundile viimastel kuudel.Alexanderi seksuaalsus on olnud spekulatsioonide ja vastuolude teema. Ükski iidne allikas ei öelnud, et Aleksandril oli homoseksuaalsed suhted või et Aleksander suhe Hephaestioniga oli seksuaalne. Aelian kirjutab siiski Aleksander külastusest Troojale, kus "Aleksander tõi hukka Achilleuse ja Hephaestioni haua Patroclusest, viimane näitas, et tema oli Aleksander armastatud, just nagu Patroclus oli Achilles." Märkides, et sõna eromenos (iidse kreeka keelt armastatud jaoks) ei pruugi seksuaalne tähendus olla, võib Alexander olla biseksuaalne, mis tema ajal ei olnud vastuoluline.Roheline väidab, et vanadel allikatel on vähe tõendeid, et Aleksandril oli naiste jaoks palju sooline huvi; ta ei andnud pärijat kuni oma elu lõpuni. Kuid ta oli suhteliselt noor, kui ta suri, ja Ogden soovitab, et Alexanderi abielupaar on rohkem muljetavaldav kui tema isa samal vanusel. Peale abikaasa oli Aleksandr palju rohkem naissoost kaaslasi. Aleksandr kogus Pärsia kuningate stiilis haremmi, kuid kasutas seda üsna säästlikult, nähes enesekontrolli "keha naudingutesse".Sellest hoolimata kirjeldas Plutarch, kuidas Roxana armastas Aleksanderit, täiustades teda, et ta ise teda ei sundinud. Roheline soovitas, et ajavahemiku kontekstis kujundas Aleksandr üsna tugevaid sõprussuhteid naistega, kaasa arvatud Caria Ada, kes teda võtsid vastu ja isegi Darius 'ema Sisygambis, kes suri maha Aleksandri surma kuulmisel..
|